Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LCHNA4D1U4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCHNA4D1U4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms