Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms