Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CSAG2Q9Y5P2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSAG2Q9Y5P2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms