Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2APQ9Y5K6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD2APQ9Y5K6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms