Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED16Q9Y2X0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms