Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms