Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC2Q9Y235 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms