Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD1Q9UP38 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD1Q9UP38 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms