Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RARRES3Q9UL19 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms