Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXO4Q9UKT5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms