Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms