Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms