Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSKSQ9UJT2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms