Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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