Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms