Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms