Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APEX2Q9UBZ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms