Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms