Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNFX1Q9P2E3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNFX1Q9P2E3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms