Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP36Q9P275 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms