Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms