Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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