Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms