Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms