Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms