Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms