Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms