Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms