Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUOX2Q9NRD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms