Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms