Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms