Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms