Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCAS3Q9H6U6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms