Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms