Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms