Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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FOXQ1Q9C009 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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