Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIFKQ9BYG3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms