Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms