Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms