Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms