Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms