Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD2Q9BTF0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms