Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TINF2Q9BSI4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TINF2Q9BSI4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms