Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms