Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3CQ99985 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms