Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3GL3Q99963 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms