Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms