Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms