Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms