Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms